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Bases de datos de Patógenos

PhotobacteriumDB posee la información del genoma de la bacteria Photobacterium damselae subsp. piscicida, una bacteria patógena de peces marinos de aguas cálidas. La información total recogida en la base de datos es de 4.8 Mb. El número total de contigs es de 25 siendo el más largo de 2.6 Mb. La base de datos contiene 4.017 secuencias codificantes y 114 ARNs.

photobacteriumdb
 
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BonamiaDB reune toda la información genética sobre el transcriptoma de Bonamia ostreae, un parásito patógeno que afecta a diferentes moluscos incluyendo las ostras. La base de datos contiene la información equivalente a 38.1Gb procedentes de 377,761,590 secuencias que se han ensamblado en 11.042 contigs.
bonamiadb
 
Acceso a la base de datos
 
 
HerpesvirusDB posee la información genetica para distintas regiones del genoma de aislados de herpesvirus, un virus que ha diezmado las poblaciones de ostras en el sur de Europa. En la base de datos se indica el origen del aislado, la región analizada y su acceso a la secuencia analizada.
herpesvirusdb 
 
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Acceso:
 
Para acceder a la base de datos será necesario un registro previo. Este registro es libre para todos los usuarios pertenecientes a organizaciones de la EU y SUDOE que tenga por objeto el desarrollo de la acuicultura del lenguado y cualquier organización sin ánimo de lucro interesada en la acuicultura y biotecnología.
 
Toda la información respecto a los usuarios se describe en los “Términos y condiciones de uso de la base de datos” que podrán descargarlo de la página web. Para acceder deberán leer y aceptar los términos y condiciones de uso y enviarlo a: manuel.manchado@juntadeandalucia.es. En el menor plazo posible recibirán su clave y usuario de acceso.