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Actividades

Las actividades del proyecto AQUAGENET se vertebran en 7 grupos de tareas (GT) distribuidos en grupos de tareas específicos (color rojo) y grupos de tareas transversales (color azul), siendo éstos últimos relativos a la gestión, seguimiento, publicidad, información y capitalización del proyecto. De forma genérica, se ha establecido un calendario de hasta 8 reuniones y seminarios de carácter semestral cuyo objetivo general es divulgar las herramientas biotecnológicas, importancia y avances del proyecto. Las reuniones programadas se realizarán en los tres países y regiones de los socios participantes en el proyecto.
 
esquema_actividades_aquagenet
 
 
  GT2: GENERACIÓN DE RECURSOS GENÓMICOS USANDO NGS
 
Coordinador de tarea y Responsable de comunicación:
Dr. Josep V. Planas
Teléfono/Fax: 93-403 93 84 / 93-411 03 58
e-mail: jplanas@ub.edu

GT1

Especies objetivo:
  • Peces: Lenguado (Solea spp).
  • Moluscos: Ostiones, mejillones y almejas.
  • Patógenos: Virus: herpes virus; Parásitos: Bonamia ostreae y Bonamia exitiosa; Bacterias: Photobacterium damselae subespecie piscicida.
 
Este grupo de tareas conlleva la realización de las siguientes acciones:
 
Acción 1 Implementación de NGS para generación de recursos genómicos en peces.
Fishomics (IFAPA, UB, IFREMER, UCA).
 
Acción 2 Implementación de NGS para generación de recursos genómicos en moluscos.
Molluscomics (IPIMAR, ISEM, IFREMER, UCA).
 
Acción 3 Implementación de NGS para generación de recursos genómicos en patógenos.
Pathogenomics (IFAPA, IFREMER).
  
Acción 4 Ensamblaje y anotación de los resultados logrados en las acciones 1 (peces), 2 (moluscos) y 3 (patógenos). Creación de bases de datos para manejo y análisis (IFAPA, UB, IPIMAR, ISEM, IFREMER, UCA).

   
 
  GT3: BIOTECNOLOGÍA EN PECES
 
Coordinador de tarea y Responsable de comunicación:
Dra. Laureana Rebordinos González
Teléfono/Fax: 956 01 61 81 / 956 01 64 48
e-mail: laureana.rebordinos@uca.es

foto actividades G3

Las especies objetivo son:
  • Peces: Lenguado (Solea senegalensis y Solea solea).
 
Este grupo de tareas conlleva la realización de las siguientes acciones:
 
Acción 1
Análisis comparado de secuencias entre especies de peces (IFAPA, UB, IFREMER, UCA).
 
Acción 2 Optimización y desarrollo de una herramienta array de alto rendimiento y más avanzadas para estudios funcionales en lenguado (IFAPA, UB).
 
Acción 3 Evaluación de factores ambientales en la producción de lenguado. La salinidad como factor condicionante del bienestar y de su capacidad productiva (IFAPA).
 
Acción 4 Regulación de la remodelación de tejidos durante la metamorfosis del lenguado y sus efectos en la acuicultura. La nutrición y las condiciones ambientales como factores claves que afectan los procesos de transformación durante el desarrollo larvario (IFAPA, IFREMER).
  
Acción 5 Identificación de los mecanismos que determinan el desarrollo asimétrico del músculo en embriones y larvas (IFREMER).
 
Acción 6 Screening de genes con un perfil asimétrico en embriones y larvas y su efecto sobre las malformaciones como limitante de la producción acuícola (IFREMER).
  
Acción 7 Mejora de la reproducción y control del sexo para conseguir reproductores de alta calidad en lenguado (UB).
 
Acción 8 Desarrollo de marcadores citogenéticos para cada cromosoma en lenguado para la validación del mapa genético (UCA).
   
 
 
  GT4: BIOTECNOLOGÍA EN MOLUSCOS
Coordinador de tarea:
Dra. Alexandra Leitão
Teléfono: 00351 281326951
e-mail: aleitao@ipimar.pt
 
Responsable de comunicación:
Dr. Frederico Batista
Teléfono: 00351 281326951
e-mail: fbatista@ipimar.pt

GT4

Las especies objetivo son:

  • Moluscos: Ostiones, mejillones y almejas.
 
Este grupo de tareas conlleva la realización de las siguientes acciones:
 
Acción 1 Análisis comparado de secuencias entre especies de peces (IPIMAR, UCA, IFREMER, ISEM).
 
Acción 2 Diferenciación de especies (ostras y mejillones). Desarrollo de herramientas de análisis basadas en NGS para su aplicación en acuicultura (IPIMAR, IFREMER, UCA, ISEM).
 
Acción 3 Caracterización genética de poblaciones (ostras, mejillones, almejas). Desarrollo de herramientas de análisis basadas en NGS para la gestión en acuicultura (IPIMAR, UCA, IFREMER, ISEM).
 
Acción 4 Éxito reproductivo (almejas). Diseño de herramientas biotecnológicas basadas en NGS para su aplicación al manejo y gestión en instalación acuícolas (IPIMAR).
 
Acción 5 Desarrollo de marcadores citogenéticos en ostras y almejas. Caracterización de genomas y su implicaciones evolutivas. (IPIMAR, UCA).

    
 
  GT5: BIOTECNOLOGÍA EN PATÓGENOS

Coordinador de tarea:
Dr. Marie Laure Begout
Teléfono/Fax: 05 46 50 06 08 / 05 46 50 06 00
e-mail: Marie.Laure.Begout@ifremer.fr

Responsable de comunicación:

Dr Xavier Cousin
Teléfono/Fax: 05 46 50 06 21 / 05 46 50 06 00
e-mail: xavier.cousin@ifremer.fr

GT5

 
Este grupo de tareas conlleva la realización de las siguientes acciones:
 
Acción 1 Análisis comparado de secuencias. Estudios in silico para identificación de genes y regiones de interés a través microorganismos previamente caracterizados (IFREMER, IFAPA).
 
Acción 2 Diferenciación de especies. Desarrollo de herramientas biotecnológicas basadas en NGS para su aplicación en la identificación de Bonamia (Bonamia ostreae y Bonamia exitiosa) (IFREMER).
 
Acción 3 Diferenciación poblacional. Desarrollo de herramientas biotecnológicas basadas en NGS para su aplicación en la identificación de herpesvirus (IFREMER).
 
Acción 4 Vacunas DNA. Desarrollo de vacunas orales basadas en nanotecnología para luchar contra la photobacteriosis (IFAPA).