Cuando se entra por primera vez en una página que contiene un applet JClic se ejecuta un módulo javascript que comprueba si el ordenador tiene correctamente instalado el motor Java. En caso negativo aparece un mensaje que dirige la navegación hacia la página de descarga.

La puesta en marcha del motor Java puede tardar unos cuantos segundos, durante los cuales se visualiza un rectángulo gris en la zona en la que debería aparecer el applet. Cuando se haya cargado aparecerá un icono en la barra de tareas. Este icono seguirá mostrándose mientras se mantenga abierta alguna ventana del navegador. Si está visible significa que el motor Java está en memoria y la carga de los applets se realiza más rápidamente. A continuación aparecerá una ventana de diálogo que pide permiso para ejecutar el applet. Si hacéis clic en Grant always (o en Conceder siempre si aparece en español) los applets JClic se cargarán automáticamente sin volver a solicitar permisos.

3. Una vez validada esta pantalla el motor Java descargará los archivos necesarios para poner en marcha JClic. Este proceso puede tardar también algunos minutos, dependiendo de la velocidad de conexión a Internet, pero solo se realiza la primera vez que se visita un applet JClic, o cuando exista alguna nueva versión disponible en el servidor.
   
   
   
4. El último paso consiste en la carga del paquete de actividades que estéis visitando. Esto puede tardar más o menos dependiendo del su tamaño. Algunos paquetes de actividades se cargan enteros al inicio, y otros cargan solo los componentes básicos y van solicitando al servidor los ingredientes (imágenes, sonidos...) a medida que se van necesitando. En este segundo caso el paquete se pone en marcha más rápidamente, pero pueden producirse retardos en el paso de una actividad a otra. Una animación en la barra de tareas de JClic indica que se está descargando algún archivo y hay que esperar.