Después de varios años de inactividad tras su dotación, el Taller de Restauración se puso en marcha a finales de 1999. Desde un principio se iniciaron los trabajos de restauración de documentos del propio Archivo, principalmente los protocolos notariales. En el año 2001, la Delegación Provincial de Cultura decide que el taller se encargue también de la restauración de documentos de toda la provincia de Cádiz, tomando como centro de operaciones el Archivo Histórico Provincial.
El Taller de Restauración del Archivo Histórico Provincial de Cádiz es uno de los mejor dotados de Andalucía. Ocupa un superficie de 84 m2 que se subdividen en cuatro áreas con su correspondiente equipamiento técnico: