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El litoral es una de las zonas del territorio andaluz que más problemas y oportunidades genera en la actualidad, no sólo por su desarrollo económico sino también por el estado de su medio ambiente.
La propia situación geográfica, extensión, climatología, y variedad de playas, junto con a las reservas ecológicas naturales hacen de la Comunidad Autónoma de Andalucía uno de los focos más relevantes y atractivos de todo el litoral español.
Una característica definitoria del medio litoral es su relativo grado de naturalidad actual. Pese a que en algunas provincias más de la mitad de la superficie costera se halla urbanizada, en otras zonas los espacios naturales son mayoritarios; existe, pues, un gran número de espacios de enorme diversidad biológica y paisajista, que albergan una importante flora y fauna silvestre con numerosos endemismos.
La intervención del hombre en el litoral ha sido poco importante hasta las cuatro últimas décadas, pero desde entonces ha adquirido un ritmo vertiginoso, que ha llegado a impactar bruscamente en este medio. Surgieron los complejos industriales de Huelva capital y la Bahía de Algeciras, especializados en manufacturas básicas y pesadas (energía, química, petroquímica...); más tarde este desarrollo industrial se difunde alcanzando determinados puntos de la costa andaluza tan distantes entre sí como Carboneras y la Bahía de Cádiz. En todos los casos, las implantaciones industriales no fueron acompañadas de medidas correctoras de sus vertidos, por lo que generaron un deterioro creciente de la calidad de las aguas litorales.
En segundo lugar, el nacimiento de urbanizaciones asociadas al crecimiento de ciudades medias y pequeñas del litoral supone un importante impacto por el vertido masivo de aguas residuales urbanas al medio marino, al haberse ido construyendo con un retraso notable las infraestructuras de depuración.
En tercer lugar el auge del turismo ha supuesto una oleada expansiva del proceso de urbanización del medio litoral, con impactos muy diversos (alteración de la dinámica litoral y de la línea de la costa, transformación de los paisajes rurales y naturales, contaminación dispersa...) que en algunos casos tiene un carácter irreversible.
Por último, las nuevas agriculturas y la acuicultura son dos tipos de aprovechamientos primarios intensivos del medio que van acompañadas de infraestructuras de apoyo cada vez más numerosas, con un creciente impacto, bien por vertidos (plásticos, aguas residuales, escombros...) o por la transformación paisajística que suponen.
Vigilancia y control

La Consejería de Medio Ambiente de la Junta de Andalucía tiene entre sus funciones, la vigilancia y control de la calidad de las aguas marítimo-territoriales de Andalucía. La normativa básica para el desarrollo de estas tareas es la Ley 7/1994, de 18 de mayo, de Protección Ambiental que establece el marco general para preservar y mejorar la calidad de las aguas litorales.
En líneas generales las actuaciones que la Consejería de Medio Ambiente ha venido realizando en materia de vigilancia y control de las aguas litorales pueden agruparse en tres tipos:
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