A la persona titular de la Secretaría General de Calidad e Innovación le corresponden las funciones previstas en el artículo 28 de la Ley 9/2007, de 22 de octubre, todas las funciones relacionadas con las políticas de calidad e innovación en materia de salud, servicios sociales y atención a la dependencia, así como el desarrollo de las estrategias de continuidad, coordinación e integralidad de estas tres áreas y, de manera especifica, las siguientes funciones:

• La planificación en general de los recursos sanitarios y de servicios sociales, y en particular, la planificación y evaluación de las políticas de calidad en los organismos y entidades dependientes de la Consejería de Salud y Bienestar Social, así como la definición y seguimiento de los instrumentos que desarrollen las citadas políticas de calidad.
• La definición, tutela y seguimiento de los Contratos-Programa y de los planes de actuación elaborados por la Consejería de Salud y Bienestar Social.
• La definición de las políticas de autorización, acreditación y certificación de calidad en el ámbito de la Consejería de Salud y Bienestar Social.
• El análisis de las necesidades y planificación estratégica de las políticas de formación, desarrollo profesional y acreditación de profesionales en el Sistema Sanitario Público de Andalucía, en el Sistema Público de Servicios Sociales de Andalucía y en el Sistema para la Autonomía y Atención a la Dependencia en Andalucía y en centros concertados, de acuerdo con la información obtenida a través de los diferentes proveedores de servicios.
• El impulso, desarrollo y coordinación de la política de investigación y desarrollo de la Consejería de Salud y Bienestar Social.
• La orientación, tutela y control técnico de la Escuela Andaluza de Salud Pública.
• La planificación estratégica y seguimiento de la Agencia de Evaluación de Tecnologías Sanitarias.
• El impulso, desarrollo y coordinación de las políticas de modernización e innovación en materia de salud y bienestar social.
• La superior dirección de las políticas de sistemas y tecnologías de la información y del conocimiento en el ámbito de  actuaciones de la Consejería de Salud y Bienestar Social y en el marco de la coordinación en materia informática de la Junta de Andalucía.
• La coordinación específica y el control de los sistemas de información, registros y estadísticas oficiales de la Consejería.
• El impulso y coordinación de las políticas de acción exterior y de relación con la Unión Europea en el ámbito sanitario, así como las de cooperación internacional para el desarrollo y la relación con las organizaciones no gubernamentales, dentro del marco de las competencias propias de la Consejería de Salud y Bienestar Social, en coordinación con la Consejería competente en materia de acción exterior.
• La coordinación general de los recursos destinados al ejercicio de las competencias que tiene atribuidas la Junta de Andalucía en materia de Personas Mayores, Infancia y Familias, así como la coordinación general de los recursos destinados al desarrollo de funciones en materia de atención a personas con discapacidad.
• La coordinación y planificación de los Servicios Sociales Comunitarios, así como la coordinación de las actuaciones que en materia de atención a las Drogodependencias se lleven a cabo en Andalucía.
• La autorización de los proyectos de investigación biomédica que comporten algún procedimiento invasivo en el ser humano.
• Y en general, todas aquellas que le atribuya la normativa vigente y las que expresamente le sean delegadas.