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DIAGNÓSTICO MICROBIOLÓGICO SEROLÓGICO Y MOLECULAR

MICROORGANISMOS. DIAGNÓSTICO SEROLÓGICO

MICROORGANISMO TÉCNICA OBJETIVO DIAGNÓSTICO MUESTRA TUBO REQUISITOS DATOS CLÍNICOS I. COMPLEMENTARIA RECOMENDACIONES
BACTERIAS
Bartonella hensellae IFI (IgG e IgM Enfermedad por arañazo de gato, bacteriemia, endocarditis, hepatitis, angiomatosis bacila Suero Gelosa tapón rojo   Sintomatología, tiempo de evolución, tratamiento antibiótico.    
Bartonella quintana

IFI (IgG e IgM)

Fiebre de las trincheras (contacto con piojos)

Suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico.    
Borrelia burgdorferi

ELFA (IgG e IgM)

Enfermedad de Lyme

Suero Gelosa tapón rojo   Síntomas    
Neuroborreliosis LCR Tubo poliestireno tapón verde Enviar conjuntamente con suero
Brucella spp. Rosa de Bengala, aglutinación, test de Coombs Sospecha de brucelosis Suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico.    
Artritis, meningitis por Brucella Líquido articular, LCR Tubo poliestireno tapón verde Enviar conjuntamente con suero
Chlamydia trachomatis

IFI (IgG)

ITS, tracoma y neumonía (neonatos)

Suero Gelosa tapón rojo   Síntomas, tiempo de evolución Más sensibles las pruebas moleculares  
Chlamydophila pneumoniae IFI (IgG) Neumonía Suero Gelosa tapón rojo Suero de fase aguda y convaleciente Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico. Durante la fase aguda los anticuerpos son negativos En fase aguda, solicitar PCR en muestra respiratoria
Chlamydophila psittaci IFI (IgG) Neumonía tras contacto con aves Suero Gelosa tapón rojo Suero de fase aguda y convaleciente Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico. Durante la fase aguda los anticuerpos son negativos En fase aguda, solicitar PCR en muestra respiratoria
Coxiella burnetii IFI fase I y fase II, (IgG e IgM) Fiebre Q Suero Gelosa tapón rojo Suero de fase aguda y convaleciente Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico. Durante la fase aguda los anticuerpos son negativos  
Legionella pneumophila serogrupo 1 IFI (IgG) Neumonía atípica Suero Gelosa tapón rojo Suero de fase aguda y convaleciente Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico.    
Leptospira spp. HAI Sospecha de inf. por leptospira Suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico. Contacto con animales  
Micoplasma pneumoniae EIA (IgM) Neumonía atípica, miopericarditis, miopatías, anemia hemolítica Suero Gelosa tapón rojo Suero de fase aguda y convaleciente Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico. Durante la fase aguda los anticuerpos son negativos En fase aguda, solicitar PCR en muestra respiratoria
Rickettsia conorii IFI (IgG) Fiebre botonosa Suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico    
Treponema pallidum Despistaje (IQL), TPHA, RPR Sífilis Suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico. Durante el chancro la serología es negativa  
Neurosífilis LCR Tubo poliestireno tapón verde Enviar conjuntamente con suero Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico. Durante el chancro la serología es negativa
Yersinia enterocolitica Aglutinación Diagnóstico serológico de infecciones por Y. enterocolitica Suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico.    
Yersinia pseudotuberculosis Aglutinación Diagnóstico serológico de infecciones por Y. pseudotuberculosis Suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico.    
HONGOS
Aspergillus Galactomanano Aglutinación pasiva Diagnóstico de aspergilosis invasiva y control del tratamiento Suero Gelosa tapón rojo     Los resultados positivos requieren confirmación (8-14% de falsos positivos) No aptos sueros lipémicos, hemolizados ni contaminados
BAL Tubo poliestireno tapón verde     Mayor sensibilidad que en suero  
Candida albicans IFI IgG anti-micelio Candidiasis invasiva Suero Gelosa tapón rojo        
Criptococcus neoformans antígeno Aglutinación con partículas de látex Criptococosis Suero Gelosa tapón rojo   Inmunosupresión, sintomatología Títulos bajos valorar con clínica  
LCR Tubo poliestireno tapón verde
PARÁSITOS
Echinococcus granulosus IHA Quiste hidatídico Suero Gelosa tapón rojo     Los quistes calcificados pueden ser seronegativos No aptos sueros lipémicos, hemolizados ni contaminados
Entamoeba histolytica IFI (IgG) Amebiasis extra-intestinal Suero Gelosa tapón rojo        
Leishmania infantum IFI (IgG) Leishmaniasis visceral Suero Gelosa tapón rojo   Antecedentes epidemiológicos    
Plasmodium falciparum IFI (IgG) Paludismo (P. falciparum o P. vivax) Suero Gelosa tapón rojo   País de origen o estancia y tiempo    
Schistosoma IgG                
Toxoplasma gondii ELFA (IgG e IgM y avidez) Toxoplasmosis aguda o reactivación (ID) Suero Gelosa tapón rojo     En caso de IgM positivos, se realizará test de avidez y, si baja, PCR  
Sospecha de infección cerebral, ocular o intrauterina LCR, humor acuoso o L. amniótico Tubo poliestireno tapón verde Enviar conjuntamente con suero Determinación recomendada: PCR
Trypanosoma cruzi IC en fase sólida (IgG) test rápido E. de chagas Sangre total, suero o plasma EDTA o gelosa tapón rojo   País de origen o estancia y tiempo Los resultados positivos deben confirmarse  
VIRUS
Virus de la hepatitis A Ig total EIA-IQL Inmunidad frente al virus de la hepatitis A Plasma o suero Gelosa tapón rojo        
Virus de la hepatitis A IgM EIA-IQL Hepatitis A aguda Plasma o suero Gelosa tapón rojo Transaminasas elevadas      
Virus de la hepatitis B (VHB). Estadiaje. HBs antígeno y anticuerpos frente a HBc y HBs Diferenciar entre inmunidad, hepatitis B activa y pasada            
VHB anticuerpos frente al antígeno de superficie (aHBs) EIA-IQL (IgG) Valoración de inmunidad frente al VHB (vacunación) o estadiaje (infección activa o resuelta) Plasma o suero Gelosa tapón rojo No solicitar si vacunación reciente      
VHB antígeno de superficie (HBsAG) EIA-IQL Diagnóstico de hepatitis B aguda, crónica, congénita o reactivación Plasma o suero Gelosa tapón rojo No solicitar si vacunación reciente      
VHB anticuerpos frente al antígeno core (aHBc) EIA-IQL Estadiaje de hepatitis B Plasma o suero Gelosa tapón rojo        
VHB anticuerpos IgM frente al antígeno core (aHBc-IgM) EIA-IQL Hepatitis B aguda o reactivación Plasma o suero Gelosa tapón rojo        
VHB antígeno e (HBeAG) EIA-IQL Hepatitis B aguda y grado de replicación e infectividad en hepatitis B crónica Plasma o suero Gelosa tapón rojo        
VHB anticuerpos frente al antígeno e (aHBe) EIA-IQL Infectividad y replicación en hepatitis B crónica y portadores inactivos Plasma o suero Gelosa tapón rojo        
Virus de la hepatitis C (VHC) EIA (IgG) Hepatitis C activa o resuelta Plasma o suero Gelosa tapón rojo     Periodo ventana: 6-8 semanas. Para infección aguda y diferenciar activa de resuelta, solicitar carga viral  
VHC IB IB Valoración de índices bajos de anticuerpos Suero Gelosa tapón rojo        
Virus de la hepatitis D anticuerpos (IgG, IgM) y antígeno EIA (H.U. Puerto Real) Hepatitis D aguda o reactivación Suero Gelosa tapón rojo HBsAG positivo      
Virus de la hepatitis E (IgG e IgM) EIA Hepatitis E aguda o antecedentes Plasma o suero Gelosa tapón rojo        
Virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) EIA-IQL Virus de la inmunodeficiencia humana Plasma o suero Gelosa tapón rojo        
VIH IB IB Confirmación anticuerpos específicos VIH 1 y 2 Suero Gelosa tapón rojo        
HTLV-I-II EIA Diagnóstico de infecciones asociadas a HTLV 1 o 2 Plasma o suero Gelosa tapón rojo   Diagnóstico y país de origen Los resultados positivos deben confirmarse con IB  
Adenovirus IgA EIA (IgA) Infecciones respiratorias, conjuntivitis,  Plasma o suero Gelosa tapón rojo        
Citomegalovirus (CMV) IQL (IgG e IgM) Mononucleosis infecciosa inf. congénita, reactivación (ID) y control pre-trasplante Plasma o suero Gelosa tapón rojo En neonatos, enviar conjuntamente suero materno. Tiempo de evolución Prueba de elección para infección congénita: PCR en orina. Diagnóstico precoz en trasplantados y control de tratamiento: carga viral  
CMV avidez ELFA (IgG) Diferenciar infección reciente/antigua cuando anticuerpos IgM positivos Suero Gelosa tapón rojo        
Virus Chikungunya IC en fase sólida (IgM) test rápido Infección aguda o reciente Sangre total, suero o plasma EDTA o gelosa tapón rojo   Sintomatología y país de origen o de viaje reciente. Requiere pruebas complementarias para confirmar  
Virus Coxsackie (A y B) EIA (IgA) Meningitis aséptica, mioperidarditis, enf. mano-pie-boca y otras asociadas Plasma o suero Gelosa tapón rojo        
Virus Dengue IC en fase sólida (IgG e IgM) test rápido Infección aguda,  antecedentes o control de gestantes de países endémicos Plasma o suero Gelosa tapón rojo Requiere confirmación con prueba alternativa Sintomatología y antecedentes epidemiológicos.    
Virus Epstein-Barr (VEB) Anticuerpos frente a VCA (IgG e IgM, IQL) y EBNA (IgG, ELISA) Mononucleosis infecciosa, reactivación (ID), PTLD y control pre-trasplante Plasma o suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución    
Erythrovirus B19 (B19) EIA (IgG e IgM) Infeccion aguda, crónica (ID) o inmunidad Plasma o suero Gelosa tapón rojo   Motivo de la solicitud, tiempo de evolución    
Herpes simple 1 y 2 IQL (IgG) y ELISA (IgM) Infección aguda, perinatal, reactivación (ID) y control pre-trasplante Plasma o suero Gelosa tapón rojo        
Herpes simple 2 ELISA (IgG) ITS, elección de tratamiento antiviral Suero Gelosa tapón rojo   Diagnóstico    
Parotiditis ELISA (IgG e IgM) Examen de salud (IgG), infección aguda, inf. Neurológica  Suero Gelosa tapón rojo        
ELISA (IgG) Infección vírica del SNC LCR Tubo poliestireno tapón verde Enviar conjuntamente con suero      
Rubeola ELFA (IgG e IgM) Examen de salud (IgG), infección aguda, inf. Congénita Suero Gelosa tapón rojo En neonatos, enviar conjuntamente suero materno.      
Sarampión ELISA (IgG e IgM) Examen de salud (IgG), infección aguda, inf. Neurológica  Suero Gelosa tapón rojo        
ELISA (IgG) Infección vírica del SNC LCR Tubo poliestireno tapón verde Enviar conjuntamente con suero      
Varicela-zoster ELISA (IgG e IgM) Varicela, herpes zoster e inf. perinatal Suero Gelosa tapón rojo   Sintomatología    
Varicela urgente ELFA (IgG) Estado inmunológico de la embarazada con contacto de riesgo Suero Gelosa tapón rojo Entregar directamente en Microbiología      

PERFILES SEROLOGÍA

PERFIL PRUEBAS/MICROORGANISMOS OBJETIVO DIAGNÓSTICO MUESTRA TUBO REQUISITOS DATOS CLÍNICOS RECOMENDACIONES
ARTRITIS Anticuerpos frente a Brucella, Yersinia, Treponema, Borrelia, Chlamidia, Mycoplasma, VEB, Rubeola, virus Coxsackie y Erythrovirus Estudio de artritis infecciosa Suero Gelosa tapón rojo Origen infeccioso Antecedentes orientativos  
L. articular Tubo poliestireno tapón verde Enviar conjuntamente con suero.
ADENOPATIAS Anticuerpos frente a Brucella, Bartonella, Toxoplasma, VEB, CMV y Rubeola Estudio de adenopatías Suero Gelosa tapón rojo   Especificar antecedentes de interés y localización.  En adolescentes y adultos, incluir VIH
ANEMIA HEMOLITICA Anticuerpos frente a Coxiella, Mycoplasma, VEB, CMV, Eritrovirus y VIH Estudio de anemia hemolítica Suero Gelosa tapón rojo      
CONTROL GESTACIONAL 1º TRIMESTRE Serología de VIH, VHB, sífilis y rubeola (si no constancia de inmunidad). VHC sólo en personas de riesgo o inmunodeprimidas. Chagas (inmigrantes o estancia en zona endémica) Control serológico de la embarazada según PAI ed. 2014 Suero Gelosa tapón rojo   Diagnóstico y edad gestacional  
DONANTE DE ÓRGANOS-PRETRASPLANTE Anticuerpos frente a Treponema, Toxoplasma, VEB, CMV, VHS 1 y 2 y VVZ Control serológico de donante y/o receptor de órganos Suero Gelosa tapón rojo   Especificar donante/receptor  
ENDOCARDITIS Anticuerpos frente a Bartonella, Borrelia, Coxiella, Mycoplasma y virus Coxsackie Diagnóstico serológico de endocarditis Suero Gelosa tapón rojo      
Si lo anterior es negativo, descartar Brucella y Legionella
ENFERMEDADES HEMATOLÓGICAS Anticuerpos frente a VEB, CMV, VHS 1-2, VVZ y Erythrovirus.  Estudio de infecciones virales con alteraciones hematológicas Suero Gelosa tapón rojo   Antecedentes de interés  
Añadir Leishmania y Mycoplasma si antecedentes compatibles
ERITEMA NODOSO Anticuerpos frente a Yersinia, Treponema, Chlamidia, Mycoplasma, Toxoplasma y VEB Diagnóstico serológico del eritema nodoso Suero Gelosa tapón rojo   Descartar también TBC  
Si lo anterior es negativo, descartar VIH, HBsAG, Leptospira y F.Q.
ESTUDIO DE INMUNODEFICIENCIAS Inmunidad frente a varicela, sarampión, parotiditis y rubeola Control de inmunodeficiencias Suero Gelosa tapón rojo      
EXAMEN DE SALUD E INMUNODEPRIMIDOS PRE-VACUNAL Anticuerpos frente a VIH, VHB, VHC e inmunidad frente a vacunales (varicela, sarampión, parotiditis y rubeola) Examen de salud laboral y estudio pre-vacunal en inmunodeprimidos y candidatos a tratamientos biológicos o inmunosupresores Suero Gelosa tapón rojo   Motivo de la solicitud  
FIEBRE DE ORIGEN DESCONOCIDO Y FIEBRE DE DURACIÓN INTERMEDIA Anticuerpos frente a Brucella, Rickettsia conori, FQ, VEB, CMV y VIH Estudio de causas infecciosas en FOD Suero Gelosa tapón rojo Cumplir criterios de FOD o FDI Especificar antecedentes epidemiológicos  
GUILLAIN-BARRE Anticuerpos frente a Mycoplasma, VEB, CMV, VHS, VVZ Infecciones asociadas al S. de Guillain Barre Suero Gelosa tapón rojo   Antecedentes de interés  
Si lo anterior negativo, VIH, VHB y VHC.
HEPATITIS VÍRICA AGUDA VHA (IgM), VHC y HBsAG Hepatitis vírica aguda Suero Gelosa tapón rojo Citolisis    
HEPATITIS: OTRAS CAUSAS INFECCIOSAS Anticuerpos frente a Coxiella, VEB, CMV, VHS y VVZ Estudio de otras causas de hepatitis infecciosa descartadas las hepatitis A, B y C. Suero Gelosa tapón rojo   Antecedentes de interés  
Si estos son negativos, solicitar VIH, Brucella, Treponema, Borrelia y Leptospira
INFECCIÓN . CONGENITA/PERINATAL Anticuerpos frente a Treponema, Toxoplasma, CMV, VHS, VVZ, Rubeola, virus Coxsackie y Erythrovirus Estudio de infecciones congénitas o perinatales Suero Gelosa tapón rojo Muestra simultánea de madre e hijo Antecedentes de interés  
INFECCONES DE TRANSMISIÓN SEXUAL Anticuerpos frente a Treponema, C. trachomatis y VHS-2 Infecciones por estos microorganismos Suero Gelosa tapón rojo   En la fase de chancro la serología de sífilis es negativa Se recomienda estudio por PCR de exudado genital/orina
INFECCIONES RESPIRATORIAS EN LA INFANCIA Anticuerpos frente a Legionella. C. pneumoniae, C. psitacci y C. trachomatis, Mycoplasma y Adenovirus Infecciones respiratorias de la infancia por microorganismos no cultivables Suero Gelosa tapón rojo Enviar muestra de fase aguda y convaleciente (15 días después) Especificar tiempo de evolución y tratamiento antibiótico  
MARCADORES DE HEPATITIS Y VIH Anticuerpos frente al VIH, VHC y estadiaje del VHB(HBsAG, anti-HBc y anti-HBs) Examen de salud, pre-anestesia Suero Gelosa tapón rojo      
MIOPATIAS Anticuerpos frente a Treponema, Borrelia, Coxiella, Mycoplasma, Toxoplasma, Echinococcus, VEB, virus Coxsackie, Adenovirus y VIH Estudio de miopatías infecciosas Suero Gelosa tapón rojo      
MIOPERICARDITIS Anticuerpos frente a Legionella, Borrelia, Mycoplasma, CMV, virus Coxsackie y Adenovirus. Miopericarditis infecciosa Suero Gelosa tapón rojo   Antecedentes de interés  
L. pericárdico Tubo poliestireno tapón verde Enviar conjuntamente con suero.
MONONUCLEOSIS INFECCIOSA Anticuerpos frente a VEB y CMV (IgM). Mononucleosis infecciosa Suero Gelosa tapón rojo   Especificar antecedentes de interés y localización de adenopatías Si alta sospecha de infección VIH, solicitar carga viral
Anticuerpos frente a Toxoplasma (si adenopatía única o asimétricas
Si adolescente o adulto, solicitar VIH y, si negativo, repetir a las 3 semanas
NEUMONIA ATIPICA Anticuerpos frente a Legionella, Coxiella,  Mycoplasma, Chlamidia y Adenovirus Neumonía atípica en fase convaleciente Suero Gelosa tapón rojo Enviar muestra de fase aguda y convaleciente (15 días después) Especificar tiempo de evolución y tratamiento antibiótico  
NEUROTROPOS Anticuerpos en LCR y suero frente a Brucella, Treponema, Borrelia, Toxoplasma, virus VEB, CMV, VHS, VVZ, Sarampión, Parotiditis y Coxsackie. Antígeno de criptococo   Diagnóstico de infecciones del SNC en fase convaleciente Suero Gelosa tapón rojo Suero y LCR extraídos el mismo día  Diagnóstico y antecedentes de interés  
LCR Tubo poliestireno tapón verde
PRETRASPLANTE M. ÓSEA Serología de VIH y VHC (si seronegativos), VHB, sífilis, toxoplasma, VEB, CMV, VHS 1-2, VVZ. Antígeno de Aspergillus. Control serológico pre-trasplante de M.O. Suero Gelosa tapón rojo      
RASH CUTANEO Anticuerpos frente a Treponema, R. conori, VEB, VHS 1-2, VVZ, Sarampión, Rubeola, Coxsackie, Adenovirus y Erythrovirus B19. Infecciones exantemáticas  Suero Gelosa tapón rojo Definir el exantema (eritematoso, máculopapular, vesicular, etc.) Si clínica y antecedentes compatibles, añadir E. de Lyme
SEGUIMIENTO VIH Serología de sífilis, toxoplasma y CMV Control de pacientes VIH+ Suero Gelosa tapón rojo      
SÍNDROME CONSTITUCIONAL Anticuerpos frente a VIH, VHC, VHB, Brucella, Treponema y CMV Estudio serológico del síndrome constitucional Suero Gelosa tapón rojo      
TRASPLANTE-INMUNODEPRESIÓN Anticuerpos frente a VIH y VHC (si seronegativos), VHB, Toxoplasma, VEB, CMV, VHS 1-2 y VVZ. Antígeno de Criptococcus Control de infecciones o reactivaciones en pacientes inmunodeprimidos Suero Gelosa tapón rojo   Causa de ID  

MICROBIOLOGÍA MOLECULAR

MICROORGANISMO TÉCNICA OBJETIVO DIAGNÓSTICO MUESTRA TUBO REQUISITOS DATOS CLÍNICOS
BACTERIAS
Gen 16S ARNr PCR + secuenciación Identificación de bacterias en muestras de origen estéril con cultivo negativo Válvula cardiaca, LCR, prótesis biopsia y otras Envase estéril Cultivo previo negativo Cuadro clínico, antecedentes, tratamiento.
Bordetella pertussis y Bordetella parapertussis PCR multiplex a TR Tosferina Aspirado nasofaríngeo Tubo poliestireno tapón verde Fuerte sospecha clínica Cuadro clíniico, antecedentes, tratamiento
Exudado nasal + exudado faríngeo Escobillones con medio de transporte para virus ViralPack 
Borrelia burgdorferi PCR a TR E. de Lyme en fase inicial (eritema migrans) o tardía (artritis, afectación neurológica o cardiaca). Complementario a  serología. Biopsia cutánea Envase estéril Fase aguda (primeras 2-4 semanas) Cuadro clínico, antecedentes, tratamiento.
E. de Lyme en fase tardía (artritis, afectación neurológica o cardiaca). LCR, articular, percárdico Tubo poliestireno tapón verde Leucocitosis, proteínas elevadas. Serología positiva
Complementario a serología. Plasma Gelosa tapón nácar Serología positiva de interpretación dudosa
Mycobacterium tuberculosis complex; resistencia a rifampicina PCR a TR directo sobre muestra TBC en muestras de origen estéril. En BK+, identificación de  MTBc. Si positivo, Identificación de genes de resistencia a rifampicina.   LCR, pleural, biopsia y muestras respiratorias/orina BK+ Contenedor estéril Clinica y estudios complementarios sospechosos Cuadro clíniico, antecedentes, tratamiento
M. tuberculosis complex MDR/XDR PCR multiplex a TR Detección en MTBc de genes de resistencia a isoniazida, rifampicina, fluoroquinolonas, kanamicina y capreomicina Muestras BK+ o cepas aisladas con sospecha de multirresistencia Contenedor estéril BK+ con sospecha epidemiológica de multirresistencia Cuadro clíniico, antecedentes epidemiológicos, tratamiento
HONGOS
Pneumocystis jiroveci PCR a TR Infección respiratoria en inmunodeprimidos BAL, esputo Contenedor estéril   Cuadro clínico, tratamiento
PARÁSITOS
Toxoplasma gondii PCR a TR Toxoplasmosis cerebral, ocular, en la embarazada o congénita Plasma Gelosa tapón nácar Presencia de anticuerpos, estudios complementarios compatibles Cuadro clíniico, antecedentes, tratamiento
L. amniótico, ocular, biopsia Contenedor estéril
VIRUS
Adenovirus CV PCR a TR Infecciones en TMO, principalmente niños Plasma Gelosa tapón nácar   Diagnóstico justificativo
Virus BK CV PCR a TR Diagnóstico y control de la nefropatía asociada a VBK en trasplantados renales Plasma Gelosa tapón nácar    
Ciromegalovirus CV PCR a TR Detección y cuantificación de viremia, control de evolución y respuesta al tratamiento Plasma Gelosa tapón nácar   Cuadro clínico, motivo de la solicitud
Virus Epstein-Barr CV PCR a TR Enfermedad linfoproliferativa post-trasplante (prevención y control del tto) y linfoma relacionado con SIDA Plasma Gelosa tapón nácar   Diagnóstico justificativo
Enterovirus PCR a TR directo sobre muestra Meningitis linfocitarias, encefalitis LCR Tubo poliestireno tapón verde Estudios complementarios compatibles Cuadro clínico
Erythrovirus B19 PCR a TR Infecciones por B19 en embarazadas e ID fundamentalmente Plasma Gelosa tapón nácar   Cuadro clínico, motivo de la solicitud
L. amniótico Tubo poliestireno tapón verde
Virus herpes simple 1 y 2, virus varicela-zoster PCR multiplex a TR Infecciones asociadas Exudado de las lesiones Escobillones con medio de transporte para virus ViralPack o sin medio de transporte   Cuadro clínico, motivo de la solicitud
LCR Tubo poliestireno tapón verde
Influenza A, B, A(H1N1) PCR multiplex a TR directo sobre muestra Gripe Aspirado nasofaríngeo Tubo poliestireno tapón verde Cuadro grave, embarazadas o inmunodeprimidos. No estudio de contactos. Cuadro clíniico, antecedentes, tratamiento
Exudado nasal + exudado faríngeo Escobillones con medio de transporte para virus ViralPack 
VHB CV PCR a TR Distinguir infección activa de inactiva, HBO, control  de la HBC, control de tratamiento y diagnóstico precoz. Plasma Gelosa tapón nácar HBsAG positivo o antecedentes de hepatitis B en inmunodeprimidos Fase del tratamiento, causa de la inmunodepresión, control de hepatitis B crónica.
VHB genotipado Secuenciación masiva Identificación de mutaciones que afectan a la evolución, a la respuesta al tto o la vacuna Plasma o suero Gelosa tapón nácar Impreso de solicitud, CV >1000 y 3 ml de plasma  
VHB estudio de resistencias Secuenciación masiva Identificación de mutaciones asociadas a resistencias Plasma o suero Gelosa tapón nácar Fracaso de tratamiento, CV>1000 y 3 ml de plasma Tratamiento previo
VHC CV PCR a TR Infección aguda (periodo ventana), confirmación de inf. crónica y control de tratamiento Plasma Gelosa tapón nácar Entrega inmediata (la muestra debe ser centrifugada antes de 4 h) Finalidad de la prueba y/o semana del tratamiento
VHC genotipado PCR a TR Elección del tratamiento Plasma Gelosa tapón nácar CV>500 UI/ml  
VHC genotipado por secuenciación Secuenciación masiva Identificar genotipos cuando la PCR-TR no lo hace Plasma o suero Gelosa tapón nácar    
VHC estudio de resistencias Secuenciación masiva Identificación de mutaciones asociadas a resistencia Plasma Gelosa tapón nácar Fracaso de tratamiento o genotipo 1a  
VIH carga viral (CV) PCR a TR Estadiaje de la infección, control del TAR y diagnóstico de inf. Congénita y aguda Plasma Gelosa tapón nácar Entrega inmediata (la muestra debe ser centrifugada antes de 4 h)  
VIH estudio de resistencias Secuenciación masiva Identificación de mutaciones asociadas a resistencia a los ARV Plasma Gelosa tapón nácar Impreso de solicitud, CV >1000 y 3 ml de plasma  
VIH Subtipo Secuenciación masiva Epidemiología y previsión de respuesta al TAR Plasma Gelosa tapón nácar CV>1000 y 3 ml de plasma  
VIH tropismo Secuenciación masiva Intención de uso de antagonistas del receptor CCR5 Plasma Gelosa tapón nácar CV>1000 y 3 ml de plasma  
Virus JC PCR a TR LMP LCR Tubo poliestireno tapón verde    
Virus del papiloma humano (VPH), detección + genotipado (19 de alto riesgo y 9 de bajo riesgo) PCR multiplex a TR Diagnóstico precoz del cáncer de cérvix y de otras lesiones asociadas al VPH; despistaje. Control de la infección. Exudados genitales, perirrectales. Frotis de verrugas. Escobillones con medio de transporte para virus ViralPack o sin medio de transporte   Descripción de la lesión o motivo de la solicitud.
SÍNDROMES
Meningitis y encefalitis herpética                       
VHS 1, 2 y 6, VVZ, CMV y VEB
PCR multiplex a TR Meningitis herpética, encefalitis LCR Tubo poliestireno tapón verde Clínica y estudios complementarios compatibles Cuadro clínico, antecedentes de interés
Neumonía atípica + tosferina         
B. pertussis, B. parapertussis, Chlamydophila pneumoniae, Chlamydophila psittaci, Legionella pneumophila
PCR multiplex a TR Neumonía atípica Esputo, BAL, aspirado o escobillón nasofaríngeo Contenedor estéril Sospecha clínica/radiológica de neumonía atípica Cuadro clíniico, antecedentes, tratamiento
Uretritis                Chlamydia trachomatis-Neisseria gonorrhoeae (CT-NG) PCR multiplex a TR Uretritis y otras I.T.S. Exudados genitales, perirrectales. Escobillones con medio de transporte para virus ViralPack o sin medio de transporte Muestra tomada por especialista Cuadro clínico, motivo de la solicitud
Orina (menor sensibilidad en mujeres) Contenedor de orina 1ª orina de la mañana
Uretritis y otras ITS           C. trachomatis, N. gonorrhoeae, Mycoplasma hominis, Mycoplasma genitalium, Ureaplasma hominis, Ureaplasma parvum y Trichomonas vaginalis PCR multiplex a TR UNG y otras ITS, prostatitis, EPI, complicaciones del embarazo asociadas (aborto, parto prematuro, rotura prematura de membrana), infecciones del recién nacido. Exudados genitales Escobillones con medio de transporte para virus ViralPack o sin medio de transporte Muestra tomada por especialista Cuadro clínico, motivo de la solicitud
Orina (menor sensibilidad en mujeres) Contenedor de orina 1ª orina de la mañana
L. amniótico Tubo poliestireno tapón verde o contenedor de orina  
BACTERIAS
BAL Lavado broncoalveolar
BK+ Baciloscopia positiva
CMV Citomegalovirus
CV Carga viral
EBNA Anticuerpos frente al antígeno nuclear del VEB
EIA Enzimo-inmuno-análisis
ELFA Inmunoensayo fluorescente
ELISA Inmunoabsorción ligado a enzimas
HBC Hepatitis B crónica
HBO Hepatitis B oculta
IB Inmunoblot
IC Inmunocromatografía
ID Inmunodeprimido
IFI Inmunofluorescencia indirecta
HTLV Virus linfotrópico de células T humanas
IgA Anticuerpos IgA
IgG Anticuerpos IgG
IgM Anticuerpos IgM
IQL Inmuno-quimio-luminiscencia
ITS Infecciones de transmisión sexual
LCR Líquido cefalorraquídeo
LMP Leucoencefalopatía multifocal progresiva
MNTB Micobacterias no tuberculosas
MTB Mycobacterium tuberculosis
MTBc Mycobacterium tuberculosis complex
PCR Reacción en cadena de la polimerasa
PCR a TR PCR a tiempo real
PTLD Enfermedad linfoproliferativa post-trasplante
SNC Sistema nervioso central
TMO Trasplante de médula ósea
VCA Anticuerpos frente a la cápside del VEB
VEB Virus Epstein-Barr
VHA Virus de la hepatitis A
VHB Virus de la hepatitis B
VHC Virus de la hepatitis C
VHS Virus herpes simple
VIH Virus de la inmunodeficiencia humana
VVZ Virus varicela-zoster
UNG Uretritis no gonocócica
EPI Enfermedad pélvica inflamatoria