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MUESTRAS CLÍNICAS RECOMENDADAS PARA DIAGNÓSTICO MICROBIOLÓGICO. RECOGIDA, TRANSPORTE Y CONSERVACIÓN.

TIPOS DE INFECCIÓN MUESTRA COMENTARIOS
Bacteriemia

Sangre

 

Infecciones cardiovasculares y asociadas a dispositivos intravasculares

Endocarditis

Sangre/válvula/verrugas/catéter iv/ Piel pericatéter/Conexión del catéter

 

Pericarditis

Líquido pericárdico

 

Sistema nervioso central

Meningitis-encefalitis

LCR, hemocultivo

 

Absceso cerebral

Aspirado del absceso

 

Tracto respiratorio

Faringoamigdalitis

Exudado faríngeo

 

Estudio de portador de S.aureus

Nasal

 

Estudio de portador de gonococo

Exudado faríngeo

 

Sinusitis

Aspirado sinusal

No válido exudado nasal

Otitis media

Tímpanocentesis

 

Otitis externa

Exudado oído externo

 

Neumonía

Hemocultivo, esputo, BAS, BAL, CTO, punción transtorácica

 

Empiema y abscesos pulmonares

Líquido pleural, aspirado absceso

 

Tosferina

Lavado nasofaríngeo

 

Infecciones oculares

Conjuntivitis

Exudado conjuntival/raspado

 

Queratitis

Raspado corneal

 

Queratitis por lentillas

Raspado corneal, lentilla y líquido de lentillas

 

Endoftalmitis

Líquido intraocular

 

Infecciones gastrointestinales

Diarrea

Heces/biopsia intestinal/aspirado duodenal

 

Infecciones intraabdominales

Peritonitis

Líquido peritoneal

 

Abscesos intraperitoneales o viscerales

Aspirado absceso

 

Colecistitis

Aspirado biliar, hemocultivo

 

Infección del tracto urinario

Infección de orina

Orina por micción limpia o sondaje
Orina punción suprapúbica

Diagnóstico de bacteriuria por anaerobios y de ITU en niños

Tracto genital

Cervicitis

Exudado endocervical

 

Detección de Streptococcus agalactiae

Exudado vágino-rectal, vaginal o rectal

 

Nódulos genitales

Aspirado nódulo

 

Prostatitis

Secreción prostática

 

Úlceras genitales

Frotis úlcera

 

Uretritis

Exudado uretral

 

Verrugas genitales

Frotis verruga, biopsia

 

Virus del papiloma humano (VPH)

Exudado endocervical o vulvar

 

Vulvovaginitis

Exudado vaginal

 

Piel y tejidos blandos

Impétigo, foliculitis, erisipela, celulitis, úlceras, gangrena, abscesos cutáneos, heridas y quemaduras

Aspirados tomados con jeringa y biopsia de tejido.

Poco recomendables las recogidas con escobillón.

Huesos y articulaciones

Artritis

Líquido sinovial

 

Osteomielitis

Biopsia ósea o exudado

 

Prótesis

Exudado

 

Normas generales: Todas las muestras que se recojan en torundas con medio de transporte pueden mantenerse a temperatura ambiente/4ºC hasta su envío al laboratorio de microbiología Las biopsias nunca deben enviarse en formol.

MUESTRA DETERMINACIÓN ENVASE COMENTARIOS
Abscesos Bacterias (cultivo) Jeringa ocluida (sin aguja), frascos de hemocultivo, tioglicolato. Tomar la muestra tras limpieza y desinfección adecuada. Siempre que sea posible, obtener la muestra por aspiración. Las muestras de abscesos pueden inocularse en frasco de hemocultivo, aunque es conveniente en este caso enviar además muestra para su siembra directa en placas. Poco recomendable las recogidas con escobillón.
Aspirado duodenal Giardia lamblia (microscopía) Envase estéril de boca ancha, previamente calentado a 37ºC. Enviar inmediatamente al laboratorio. Si la muestra se enfría es difícil observar los trofozoítos de Giardia
Aspirado/exudado nasofaríngeo Bacterias (cultivo/PCR)
Virus: VRS (IC/PCR),
gripe (PCR)
Envase estéril/torunda flexible
Envase estéril.
Para gripe, en envase específico
 
Aspirado oído medio (timpanocentesis) Bacterias/hongos (cultivo) Envase estéril, jeringa ocluida (sin aguja) Enviar inmediatamente al laboratorio
Aspirado sinusal Bacterias/hongos (cultivo) Jeringa (enviar sin aguja)
o inocular en un tubo de tioglicolato
No válido exudado nasal
Enviar inmediatamente al laboratorio
BAS, BAL, punción transtorácica, CTO Bacterias/hongos (cultivo) Envase estéril de boca ancha  
Biopsias Bacterias/hongos (cultivo)
Virus (PCR)
Micobacterias (tinción, cultivo)
Envase estéril de boca ancha Introducir la biopsia en un contenedor con una pequeña cantidad de suero fisiológico estéril. NO usar formol.
Catéter Bacterias/hongos (cultivo) Envase estéril de boca ancha Segmento distal de no más de 4 cm de longitud.
Enviar en sospecha de infección asociada a catéter, siempre junto con hemocultivo
No solicitar cultivo sistemáticamente cada vez que se retire un catéter
Catéter urinario No aceptable    
Catéter drenaje No recomendable   Enviar líquido drenaje, abscesos, aspirados
Esputo Bacterias, hongos (cultivo) Envase estéril de boca ancha Es recomendable enviar el primero de la mañana, tras enjuague de la boca
Micobacterias (tinción y cultivo) Envase estéril de boca ancha Enviar muestras de tres días consecutivos (preferible primera de la mañana)
Exudado conjuntival/corneal Bacterias, hongos (cultivo) Torunda con medio de transporte, o inocular en tioglicolato  
Exudado endocervical Chlamydia trachomatis/gonococo (PCR) Torunda sin medio de transporte  
Bacterias (cultivo) Torunda con medio de transporte (2x) Enviar inmediatamente al laboratorio
VPH (PCR) Torunda sin medio de transporte (2x)  
Exudado faríngeo Bacterias, hongos (cultivo) Torunda con medio de transporte  
Virus: gripe (PCR) Envase específico. Enviar con exudado nasal
Exudado nasal S. aureus (cultivo) Torunda con medio de transporte Solicitar únicamente para estudio de portadores de Staphylococcus aureus
Gripe (PCR) Envase específico. Enviar con exudado faríngeo  
Exudado oído externo Bacterias (cultivo) Torunda con medio de transporte  
Exudado rectal Bacterias (cultivo) Torunda con medio de transporte No conservar en nevera si se sospecha ITS
Chlamydia trachomatis/gonococo (PCR)
Virus (PCR)
Torunda sin medio de transporte
Exudado uretral Chlamydia trachomatis/gonococo (PCR) Torunda sin medio de transporte  
Bacterias (cultivo) Torunda con medio de transporte No conservar en nevera si se sospecha ITS
Mycoplasma hominis
Ureaplasma urealyticum (cultivo)
Torunda con medio de transporte especial. Llamar al laboratorio  
Exudado vaginal Bacterias, hongos (cultivo) Torunda con medio de transporte (x2) No conservar en nevera si se sospecha ITS
Exudado vagino-rectal Streptococcus agalactiae (cultivo) Torunda con medio de transporte  
Heces Bacterias (cultivo) Envase estéril de boca ancha  
Toxina de Clostridium difficile (IC/PCR) Envase estéril de boca ancha  
Parásitos (microscopía) Transporte con S.A.F.
Portaobjetos en envase estéril de boca ancha
3 de 3 días no consecutivos. Para investigación de oxiuros, tomar la muestra mediante técnica de Graham (al levantarse por la mañana y antes de lavarse adherir papel autoadhesivo transparente (papel de celo) por los márgenes anales y pegar sobre una de las caras de un portaobjetos, ajustándose a su medida)
Rotavirus, adenovirus (IC) Envase estéril  
Heridas, úlceras, quemaduras, mordeduras Bacterias, hongos (cultivo) Envase estéril (biopsia), jeringa ocluida (sin aguja), tioglicolato, torunda con medio de transporte Tomar la muestra tras limpieza y desinfección adecuada. Siempre que sea posible, obtener la muestra por aspiración. Poco recomendables las recogidas con escobillón, preferible enviar biopsia: introducir la muestra en un contenedor con una pequeña cantidad de suero fisiológico estéril y NO usar formol
Jugo gástrico Micobacterias (tinción, cultivo/PCR) Envase estéril de boca ancha  
Lentes de contacto Bacterias/hongos (cultivo)
Parásitos: Acanthamoeba (microscopía, cultivo)
Enviar lentes en su estuche y también el frasco de líquido de conservación  
Lentes terapéuticas Bacterias/hongos (cultivo) Envase estéril de boca ancha/tioglicolato  
Lesiones fúngicas (piel, pelo, uñas) Hongos (cultivo) Envase estéril/placa de Petri/torunda sin medio de transporte  
Líquido amniótico Bacterias, hongos (cultivo) Envase estéril, jeringa ocluida (sin aguja), tioglicolato, frascos de hemocultivo  
Virus (PCR) Envase estéril  
Líquido cefalorraquídeo Bacterias (cultivo, Ag de neumococo por IC) Envase estéril Enviar inmediatamente al laboratorio. Si no es posible, la muestra para cultivo debe dejarse a temperatura ambiente. Para el resto de estudios puede refrigerarse. Si se extrae más de un tubo, enviar el extraído en segundo lugar a Microbiología. Indicar siempre por orden de preferencia los estudios a realizar
Hongos (cultivo) Envase estéril
Virus (PCR) Envase estéril
Serología (ELISA) Envase estéril
Parásitos Envase estéril
Micobacterias (tinción, cultivo, PCR) Envase estéril
Líquidos estériles (articular, ascítico, bilis, pericárdico, peritoneal, pleural) Bacterias (cultivo) Envase estéril/frascos de hemocultivo Enviar inmediatamente al laboratorio. Si no es posible, la muestra para cultivo debe dejarse a temperatura ambiente. Para el resto de estudios puede refrigerarse. Indicar siempre por orden de preferencia los estudios a realizar
Hongos (cultivo) Envase estéril
Virus (PCR) Envase estéril
Parásitos Envase estéril
Parásitos Envase estéril
Médula ósea Bacterias/hongos (cultivo) Envase estéril/frascos de hemocultivo  
Parásitos: Leishmania (microscopía) Envase estéril
Micobacterias (tinción, cultivo, PCR)
Nódulos genitales Bacterias (cultivo) Jeringa/ Envase estéril Aspirado nódulo
Orina (micción limpia o sondaje) Bacterias, hongos (cultivo) Envase estéril de boca ancha, sin conservante
Tubos con conservante
 
Antígeno de neumococo/Ag de Legionella (IC) Envase estéril de boca ancha
Chlamydia/gonococo (PCR) Envase estéril de boca ancha
Micobacterias (tinción, cultivo) Envase estéril de boca ancha Enviar 3 muestras de orina de 3 días consecutivos, con volumen mínimo de 20 ml cada muestra. No enviar muestras de orina de 24 horas
Orina punción suprapúbica Bacterias (cultivo) Jeringa ocluida Diagnóstico de bacteriuria por anaerobios y de ITU en niños
Prótesis y material protésico (prótesis articulares, válvulas, port-a-cath…) Bacterias (cultivo/PCR 16s)
Hongos (cultivo)
Micobacterias (tinción, cultivo, PCR 16s)
Contenedor estéril apropiado según tamaño Añadir un pequeño volumen de suero fisiológico estéril a las piezas pequeñas para evitar su desecación
Raspado corneal, córnea, casquete corneal Bacterias/hongos (cultivo) Inoculación directa en medios de cultivo (tioglicolato) Contactar previamente con el S. de Microbiología
Sangre Hemocultivo Frascos de hemocultivo Realizar siempre dos extracciones de sangre (tres en sospecha de endocarditis) de punciones independientes de vena periférica con un intervalo de entre 10 y 60 minutos. En adultos, cada extracción será de 20 ml (10 ml en frasco aerobio y 10 ml en anaerobio, por este orden).
Serología Suero (gelosa)
Virus Plasma (EDTA o K7)
Carga viral Plasma (EDTA con gelosa “tubo de tapón blanco”)
Parásitos (tinción, IC) Sangre no coagulada (EDTA)
Secreción prostática Bacterias, hongos Envase estéril de boca ancha  
Semen Bacterias (cultivo) Envase estéril de boca ancha  
Úlceras (frotis) Virus: VPH, herpes (PCR) Torunda seca (x2)  
Válvulas, verrugas cardiacas Bacterias (cultivo, PCR 16s)
Hongos (cultivo)
Envase estéril de boca ancha  
Verrugas genitales VPH
Hongos (cultivo)
Escobillón seco (x2)