Su creación oficial se realizó mediante Decreto en 1977.

La gestión del centro, de titularidad estatal, se transfirió a la Comunidad Autónoma de Andalucía por Real Decreto 864/1984, de 29 de febrero. En la actualidad se rige por el Convenio de Colaboración entre el Ministerio de Cultura y la Junta de Andalucía de 21 de mayo de 1994. En ese mismo año fue integrado plenamente en el Sistema Andaluz de Archivos.

El Archivo, de acuerdo con la legislación vigente, custodia los fondos generados por los distintos organismos de la Administración, tanto estatal como autonómica, así como la Administración Institucional y Corporativa. De igual modo, alberga archivos privados, en virtud de compra, donación o depósito.