La ZEC Rivera de Chanza coincide con la mayor parte del recorrido del río del mismo nombre a su paso por los términos municipales de Aroche, Rosal de la Frontera, Santa Bárbara de Casa y Paymogo, pertenecientes a la provincia de Huelva, constituyendo los dos primeros los límites administrativos entre las comunidades autónomas andaluza y extremeña, y los tres últimos, la frontera entre España y Portugal, concretamente con el distrito de Beja, perteneciente a la región de Alentejo.

Este espacio cumple una función esencial de corredor ecológico al poner en contacto diferentes ecosistemas, contribuyendo a la conectividad y coherencia de la trama ecológica que constituye la red Natura 2000. En concreto, conecta por el noreste con la ZEC Sierra de Aracena y Picos de Aroche y por el sur enlaza con las ZEC Río Guadiana y Ribera de Chanza y Andévalo Occidental, además de su localización muy próxima al Paraje Natural Sierra Pelada y Rivera del Aserrador. De este modo garantiza el movimiento de especies en el ámbito oeste de Sierra Morena hasta la frontera con Portugal.

Los ríos y arroyos constituyen elementos del territorio esenciales para el mantenimiento de una vegetación de ribera con coberturas y estructuras variables de juncales, berredas, gramales y espadañales, entre otras formaciones, además de otras formaciones arbóreas cuya distribución es condicionada por la distancia al cauce. Estos ambientes favorecen la presencia de determinadas especies de peces y anfibios cuya distribución es condicionada por el régimen de caudales. También es rica la avifauna que encuentra lugares de alimentación, refugio, paso y descanso. Es especialmente importante este último grupo por estar presentes de forma regular una o varias especies de aves consideradas de interés prioritario.

En cuanto a los peces presentes, destacar el jarabugo, endemismo de la penísula Ibérica y considerado como el pez primario más amenazado de Europa. Además podemos encontrar en sus aguas el pez fraile, el calandino y barbo comizo. Entre las especies de aves destacan milano real, águila imperial ibérica y cigüeña negra; entre los anfibios el sapillo pintojo meridional y sapo partero ibérico, y en el grupo de los reptiles el galápago leproso y galápago europeo.