La Laguna de La Jara forma parte del complejo lagunar de Las Madres y Dunas del Odiel cuyo origen se debe al efecto de pantalla o dique que producen los distintos frentes dunares que se sitúan a lo largo de la linea costera sobre la red de drenaje de la cuenca hidrográfica más inmediata. La circulación de las aguas superficiales se ve taponada por los sucesivos cordones dunares generados por la dinámica litoral, quedando depositada en depresiones más o menos profundas y dando lugar a estos humedales permanentes que se distribuyen a sotavento de la línea de costa.

La calidad ecológica de estos espacios contrasta con el paisaje humanizado y notablemente alterado donde se asientan. Apenas unos metros más allá de estas pequeñas masas de agua se extienden gigantescas superficies de cultivos agrícolas bajo plástico. Este es el contraste que puede apreciarse desde el observatorio de La Jara situado frente a la citada laguna. El equipamiento, de sección semicircular abierta, está construido en mampostería de ladrillo con el fin de evitar que su deterioro y la acción del vandalismo..

Desde este punto se tiene acceso a una panorámica a la Laguna de La Jara y trás ella a un paisaje dominado por las transformaciones agrícolas que se produjeron en la comarca en la década de los años 80. La abundancia de vegetación perilagunar (álamos, tarajes, carrizos, eneas, juncos, castañuelas y retamas), sirven de refugio a numerosas especies de avifauna: garcilla cangrejera, focha común, pato cuchara, ánade real, pato colorado, zampullín, somormujo, cormorán, garza real, garza imperial, garcilla bueyera, cigüeñuela, cigüeña blanca son algunas de las especies más frecuentes en la zona, sin que pueda descartarse la presencia de otras más emblemáticas y raras: cigüeña negra, malvasía, calamón, focha moruna, martinete o águila pescadora. Además no es infrecuente observar ejemplares de nutria que utilizan estas aguas como zonas de refugio y alimentación.