Este sendero está organizado en circuitos consecutivos que sortean los canales a través de pasarelas. Varios ramales lineales llevan hasta observatorios destinados a contemplar la fauna.

Las lagunas del Huerto y las Pajas conforman, junto con otras pequeñas lagunas temporales, un complejo del que también forma parte la laguna del Acebuche y que tiene su origen en el afloramiento de las aguas subterráneas, ya que el nivel freático se encuentra prácticamente en superficie en el área.

En estas zonas anegadas, diversas formaciones vegetales características se disponen en bandas, colonizando desde las orillas a las aguas interiores, además de algunos de los caños que conectan las lagunas. La flora, muy condicionada por el nivel de encharcamiento y, por tanto, con un marcado carácter estacional, presenta especies como junco de bolitas, bayunco, enea, ranúculo, grama o panizo o la llamada marsiega.

El sendero discurre en su totalidad por los cotos. Un sistema formado por espesos matorrales de composición heterogénea en el que sobresalen pequeños bosquetes de pino piñonero con pies dispersos de sabinas. Los cotos presentan diferencias en su composición vegetal en función de su cercanía al nivel freático:

- El Monte negro coloniza zonas con suelos muy húmedos, donde el nivel freático se encuentra casi superficial y, por tanto, circunda las zonas encharcadas. Es un matorral oscuro y denso en el que domina el brezo de escoba acompañado habitualmente por brecina y aulaga.

- El Monte blanco se sitúa en las zonas más secas y elevadas. Está dominado por un matorral de jaguarzo blanco al que acompaña romero macho, escobón y jaguarzo morisco, entre ostras.

En las áreas más expuestas aparecen otras especies mediterráneas, como cantueso, romero y almoradú.

Los cotos constituyen un hábitat ideal para pequeños y grandes mamíferos. Si bien son bastante esquivos, no le resultará difícil encontrar rastros de ciervo, jabalí, meloncillo, zorro, tejón... o quizá divisarlos entre la espesura del matorral. Los pequeños pinares ofrecen también zonas de nidificación ideales para diversas especies como milano real, águila calzada, cernícalo vulgar o rabilargo.