Victoria es una adolescente malagueña cuya vida se transforma, a su pesar, al verse obligada a permanecer con sus padres en una misión del Amazonas. Allí conoce a unos indios de su edad: Oroa y Yagüire que la influyen de tal forma que cambia su visión de las cosas y sus convicciones.
La Encrucijada de Cronos es un lugar de la selva, donde se cruzan las tres dimensiones del tiempo. Los tres adolescentes acceden a experiencias, en ese valle, que les llevan a visualizar a una india del pasado con ojos azules y rasgos europeos, la cual tiene un mensaje para ellos, que tendrán que descifrar. El futuro del amazona también se les muestra como un lugar árido y se prometen a sí mismos que eso no ocurrirá. Para ello se comprometen con una lucha por el ecosistema.
Datos de la situación política, económica y social del Amazonas y países limítrofes, se mezclan con la historia de los Marañones y el Dorado. El libro hace hincapié en los problemas medioambientales de la Cuenca Amazónica y está diseñado para plantear Valores y tomar conciencia.