Pantaneta de Alhama y Laguna de las Trincheras han sido incorporadas al inventario por cumplir los requisitos exigidos en cuanto a sus valores naturales, especialmente por la presencia de especies de fauna amenazadas. Laguna Seca, además de presentar importantes comunidades de microorganismos, pertenece al Parque Natural Sierra de Castril, por lo que queda automáticamente incluida en el inventario.